AlphaProteo的实验成果
- 成功设计多种蛋白质结合体: AlphaProteo成功设计了针对多种目标蛋白的结合体,涵盖了病毒蛋白和与癌症、炎症、自身免疫疾病相关的蛋白。例如:
- SARS-CoV-2刺突蛋白受体结合域(SC2RBD):这是新冠病毒的重要目标蛋白,AlphaProteo成功设计出结合体,并且实验显示这些结合体可以有效阻止病毒感染细胞。
- BHRF1病毒蛋白:这是与病毒感染相关的目标蛋白。实验表明,AlphaProteo生成的结合体有88%的成功率,大大优于现有方法。
- 相比现有方法,结合强度显著提高: AlphaProteo生成的蛋白质结合体,在七种目标蛋白上的结合强度比现有的设计方法强3到300倍。例如,针对TrkA(与癌症相关的蛋白),AlphaProteo设计的结合体比经过多轮优化的现有方法生成的结合体还要强。
- 实验成功率高: 在实验室测试中,AlphaProteo的结合体比传统方法表现出更高的实验成功率。这意味着,实验中需要测试的设计数量更少,实验效率显著提升。
- BHRF1病毒蛋白:88%的结合体设计在实验中成功。
- 其他目标蛋白:如IL-7Rɑ、PD-L1、TrkA、IL-17A等,在实验中表现出很高的成功率和结合强度。
- 与科学界的合作验证: AlphaProteo生成的结合体经过了外部科学家的独立验证。例如,Francis Crick研究所的Peter Cherepanov、Katie Bentley和David LV Bauer团队确认了AlphaProteo生成的SC2RBD和VEGF-A结合体具有预期的生物功能。具体来说,一些SC2RBD结合体能够阻止新冠病毒及其变体感染细胞。
- 应对挑战和局限性: 尽管AlphaProteo在多个实验中取得了成功,但它在面对更复杂的目标蛋白时(如TNFɑ,参与自身免疫疾病)仍存在局限性。这些蛋白质的结合设计难度较大,但团队正在持续改进AlphaProteo以应对这些挑战。
AlphaProteo的实验成果显著,成功设计了多种高结合强度的蛋白质结合体,并在多项实验中展示出比现有设计方法更高的成功率和结合力。这些成果为药物开发、病毒防治和癌症研究提供了新的工具和技术。